Conflict: Denied Ops se desarrolla en el inestable clima político de la actualidad y se centra en dos operativos de misiones encubiertas especialistas en armas y tácticas militares. A lo largo del juego, los jugadores pueden cambiar en cualquier momento de operativo para proporcionar fuego de cobertura, explorar las distintas rutas de los niveles, distraer al enemigo o dejarlo atrapado bajo el fuego.

Gracias a la nueva tecnología Puncture de Pivotal, el título presenta entornos altamente destructibles, lo que te permite abrir orificios en las paredes con tus disparos para facilitar la tarea del francotirador o derribar muros para coger por sorpresa al enemigo. El juego, que está ambientado en zonas conflictivas de Sudamérica, África y Rusia, incluye un sistema de control muy fácil de manejar, acción trepidante y abundantes escenas de fuego y destrucción al estilo de Hollywood.